www.wikidata.da-dk.nina.az

Transskriptionsfaktor er ofte skrevet transkriptionsfaktorer er proteiner der har en overordnet rolle i organismens liv

Transskriptionsfaktor

Transskriptionsfaktorer, ofte skrevet transkriptionsfaktorer, er proteiner, der har en overordnet rolle i organismens liv ved at sikre, at de rigtige gener er udtrykt i den rigtige celle på det rigtige tidspunkt og i den rigtige mængde - igennem hele livet. I molekylærbiologiske termer er en transskriptionsfaktor et sekvens-specifikt DNA-bindende protein, der regulerer omskrivningen (transskriptionen) af den genetiske information fra DNA til messenger-RNA. Reguleringen sker ved at en transskriptionsfaktor binder sig specifikt til en bestemt DNA-sekvens for derved at starte processer, der tænder eller slukker for gen-ekspressionen og derved bestemmer detailniveauet af proteinbiosyntesen. De fleste af cellens signalveje har en transskriptionsfaktor som slutpunkt.

Illustration af kompleksiteten af en aktiverende transskriptionsfaktors virkemåde
Molekylmodel af DNA og de DNA-bindende domæner af den dimere glucocorticoid-receptor, en kernereceptor og transskriptionsfaktor
”Leucinlynlåsen” findes som det DNA-bindende domæne i mange transskriptionsfaktorer i alle eukaryoter
Molekylmodel af transskriptionsfaktoren p53 i kompleks med DNA
Serum response faktor, en overordnet transskriptionsfaktor i kompleks med serum response element
p53 - en skitse af proteindomænerne (NLS = Nuclear Localization Signal)

Det menneskelige genom koder for omkring 2600 proteiner med et DNA-bindende domæne, hvoraf langt de fleste tænkes at være transskriptionsfaktorer. Det er mere end 10% af alle 20.344 af menneskets protein-kodende gener, og transskriptionsfaktorerne er dermed en af de største familier af proteiner, som kendes.

Man kender transskriptionsfaktorer, der virker alene, og transskriptionsfaktorer, der virker sammen med andre transskriptionsfaktorer eller andre proteiner for at fremme (som en aktivator) eller blokere (som en repressor) bindingen af RNA-polymerase til specifikke gener. Mange gener viser sig at være flankeret af flere bindingssteder for transskriptionsfaktorer (responselementer), hvor en effektiv transskription kræver samvirke af flere transskriptionsfaktorer.

DNA-binding Rediger

Et afgørende element for transskriptionsfaktorerne er, at de indeholder mindst et DNA-bindende proteindomæne (DBD), der knyttes til en bestemt sekvens af DNA (et responselement, en promotor eller en enhancer), som støder op til det gen eller de gener, der skal reguleres. Transskriptionsfaktorerne er inddelt i klasser baseret på arten af deres DNA-bindende domæne. Andre proteiner er også betydningsfulde for reguleringen af transskriptionen, men adskiller sig fra transskriptionsfaktorerne ved ikke at indeholde DNA-bindende domæner; det er bl.a. coaktivatorer, histon-acetyltransferaser, histon-deacetylaser, kinaser (se billedet ovenfor).

Mekanisme Rediger

Transskriptionsfaktorerne er en meget blandet familie af proteiner, der oftest fungerer i samspil med andre proteiner, der er med til at bestemme specificiteten af processerne. Transskriptionsfaktorerne bruger en bred vifte af mekanismer til regulering af genekspressionen:

  • katalysering af acetylering eller deacetylering af histoner enten direkte eller ved rekruttering af andre proteiner med denne katalytiske aktivitet.
  • rekruttering af coactivatorer eller corepressor-proteiner til transskriptionsfaktor-DNA-komplekset (se billedet).
  • binding af mikroproteiner, der danner ikke-fungerende heterodimerer med transskriptionsfaktorer.

Mutationer Rediger

En mutation i en transskriptionsfaktor kan forårsage store ændringer i reguleringen af transskriptionen/genekspressionen/proteinsyntesen og kan derved forårsage specifikke sygdomme. Gener for transskriptionsfaktorerne benævnes som oncogener fordi mutationer kan føre til kræft. De benævnes også som suppressor-gener, da den normale funktion netop ikke fører til kræftdannelse.

Nogle eksempler Rediger

  • atrophin-1, AT-1 - ekspansion af GAG i genet for AT-1 medfører indførelsen af polyQ i proteinet, hvilket forårsager ataksi-syndromet dentatorubral-pallidoluysian atrophy (DRPLA), en såkaldt “polyQ-sygdom”.
  • Serum response factor er en overordnet transskriptionsfaktor, der binder til serum response elementet, SRE, i promotor-regionen af mange gener, se billedet og en:Serum response factor.
  • p53 (tumor protein p53, cellular tumor antigen p53, phosphoprotein p53, tumor suppressor p53, antigen NY-CO-13, transformation-related protein 53 eller TRP53) er også en overordnet transskriptionsfaktor, der er centrum i et komplekst system af signalveje. I mange kræftceller findes p53 med en eller flere mutationer, der har medført ændringer i p53’s normale funktion.
  • Kernereceptorer er transskriptionsfaktorer der ud over det DNA-bindende proteindomæne (se illustrationen for oven) også har andre domæner inkl. et hormonbindende domæne.
  • NF-κB (eng. nuclear factor 'kappa-light-chain-enhancer' of activated B-cells) har stor betydning for reguleringen af immunresponset, for celleproliferation og apoptose (celledød).
  • NF-AT (eng. nuclear factor of activated T-cells) er en familie af transskriptionsfaktorer, der regulerer genekspressionen af cytokiner som f.eks. interleukin-2 (IL-2).
  • Scleraxis transskriptionsfaktorerne udgør en superfamilie karakteriseret ved at indeholde et basic helix-loop-helix proteindomæne og regulere celledifferentiering, proliferation og oncogenese.
  • GATA1 er en transskriptionsfaktor, der aktiveres af EPO i erytrocytternes forstadier og medfører produktion af cytoskelet, hæmoglobin og andre molekyler, der har betydning for udviklingen og modningen af erytrocytterne og differentiering, overlevelse og proliferation.
  • STAT er en familie af transskriptionsfaktorer, der medierer mange aspekter af cellulær immunitet, proliferation, apoptose og differentiering og regulerer bl.a. genet for insulin-like growth factor 1.
  • Oct4, Sox2, Klf4 og c-Mys er transkriptionsfaktorer for stamceller.

Cofaktorer Rediger

  • YAP1 (yes-associated protein-1) også benævnt YAP eller YAP65

Se også Rediger

Referencer og eksterne links Rediger

  1. Transcriptional Regulation by P53. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 2010
  2. cAMP Response Element-Binding Protein (CREB): A Possible Signaling Molecule Link in the Pathophysiology of Schizophrenia. Frontiers in Molecular Neuroscience 2018
  3. NF-κB signaling in inflammation. Nature 2017
  4. NFAT proteins: key regulators of T-cell development and function. Nature 2005
  5. Basic Helix-Loop-Helix. The bHLH family of transcription factors. ScienceDirect 2022
  6. GATA1 gene. GATA binding protein 1. MedlinePlus 2010
  7. Signal Transducer and Activator of Transcription (STATs) Proteins in Cancer and Inflammation: Functions and Therapeutic Implication. Frontiers in Oncology 2019
  8. Store opdagelser: Epigenetik – arvelige påvirkninger og forandringer. Videenskab.dk 2014
wikipedia, wiki, bog, bøger, bibliotek, artikel, læs, download, gratis, gratis download, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, billede, musik, sang, film, bog, spil, spil.
Udgivelsesdato:
Transskriptionsfaktorer ofte skrevet transkriptionsfaktorer er proteiner der har en overordnet rolle i organismens liv ved at sikre at de rigtige gener er udtrykt i den rigtige celle pa det rigtige tidspunkt og i den rigtige maengde igennem hele livet I molekylaerbiologiske termer er en transskriptionsfaktor et sekvens specifikt DNA bindende protein der regulerer omskrivningen transskriptionen af den genetiske information fra DNA til messenger RNA Reguleringen sker ved at en transskriptionsfaktor binder sig specifikt til en bestemt DNA sekvens for derved at starte processer der taender eller slukker for gen ekspressionen og derved bestemmer detailniveauet af proteinbiosyntesen De fleste af cellens signalveje har en transskriptionsfaktor som slutpunkt Illustration af kompleksiteten af en aktiverende transskriptionsfaktors virkemadeMolekylmodel af DNA og de DNA bindende domaener af den dimere glucocorticoid receptor en kernereceptor og transskriptionsfaktor Leucinlynlasen findes som det DNA bindende domaene i mange transskriptionsfaktorer i alle eukaryoterMolekylmodel af transskriptionsfaktoren p53 i kompleks med DNASerum response faktor en overordnet transskriptionsfaktor i kompleks med serum response elementp53 en skitse af proteindomaenerne NLS Nuclear Localization Signal Det menneskelige genom koder for omkring 2600 proteiner med et DNA bindende domaene hvoraf langt de fleste taenkes at vaere transskriptionsfaktorer Det er mere end 10 af alle 20 344 af menneskets protein kodende gener og transskriptionsfaktorerne er dermed en af de storste familier af proteiner som kendes Man kender transskriptionsfaktorer der virker alene og transskriptionsfaktorer der virker sammen med andre transskriptionsfaktorer eller andre proteiner for at fremme som en aktivator eller blokere som en repressor bindingen af RNA polymerase til specifikke gener Mange gener viser sig at vaere flankeret af flere bindingssteder for transskriptionsfaktorer responselementer hvor en effektiv transskription kraever samvirke af flere transskriptionsfaktorer Indholdsfortegnelse 1 DNA binding 2 Mekanisme 3 Mutationer 4 Nogle eksempler 4 1 Cofaktorer 5 Se ogsa 6 Referencer og eksterne linksDNA binding RedigerEt afgorende element for transskriptionsfaktorerne er at de indeholder mindst et DNA bindende proteindomaene DBD der knyttes til en bestemt sekvens af DNA et responselement en promotor eller en enhancer som stoder op til det gen eller de gener der skal reguleres Transskriptionsfaktorerne er inddelt i klasser baseret pa arten af deres DNA bindende domaene Andre proteiner er ogsa betydningsfulde for reguleringen af transskriptionen men adskiller sig fra transskriptionsfaktorerne ved ikke at indeholde DNA bindende domaener det er bl a coaktivatorer histon acetyltransferaser histon deacetylaser kinaser se billedet ovenfor Mekanisme RedigerTransskriptionsfaktorerne er en meget blandet familie af proteiner der oftest fungerer i samspil med andre proteiner der er med til at bestemme specificiteten af processerne Transskriptionsfaktorerne bruger en bred vifte af mekanismer til regulering af genekspressionen stabilisering eller blokering af bindingen af RNA polymerase til DNAkatalysering af acetylering eller deacetylering af histoner enten direkte eller ved rekruttering af andre proteiner med denne katalytiske aktivitet rekruttering af coactivatorer eller corepressor proteiner til transskriptionsfaktor DNA komplekset se billedet binding af mikroproteiner der danner ikke fungerende heterodimerer med transskriptionsfaktorer Mutationer RedigerEn mutation i en transskriptionsfaktor kan forarsage store aendringer i reguleringen af transskriptionen genekspressionen proteinsyntesen og kan derved forarsage specifikke sygdomme Gener for transskriptionsfaktorerne benaevnes som oncogener fordi mutationer kan fore til kraeft De benaevnes ogsa som suppressor gener da den normale funktion netop ikke forer til kraeftdannelse Nogle eksempler Redigeratrophin 1 AT 1 ekspansion af GAG i genet for AT 1 medforer indforelsen af polyQ i proteinet hvilket forarsager ataksi syndromet dentatorubral pallidoluysian atrophy DRPLA en sakaldt polyQ sygdom Serum response factor er en overordnet transskriptionsfaktor der binder til serum response elementet SRE i promotor regionen af mange gener se billedet og en Serum response factor p53 tumor protein p53 cellular tumor antigen p53 phosphoprotein p53 tumor suppressor p53 antigen NY CO 13 transformation related protein 53 eller TRP53 er ogsa en overordnet transskriptionsfaktor der er centrum i et komplekst system af signalveje 1 I mange kraeftceller findes p53 med en eller flere mutationer der har medfort aendringer i p53 s normale funktion Kernereceptorer er transskriptionsfaktorer der ud over det DNA bindende proteindomaene se illustrationen for oven ogsa har andre domaener inkl et hormonbindende domaene CREB eng cAMP response element binding protein har bl a betydning for langtidshukommelse neuroplasticitet Alzheimers sygdom og skizofreni 2 NF kB eng nuclear factor kappa light chain enhancer of activated B cells har stor betydning for reguleringen af immunresponset for celleproliferation og apoptose celledod 3 NF AT eng nuclear factor of activated T cells er en familie af transskriptionsfaktorer der regulerer genekspressionen af cytokiner som f eks interleukin 2 IL 2 4 Scleraxis transskriptionsfaktorerne udgor en superfamilie karakteriseret ved at indeholde et basic helix loop helix proteindomaene og regulere celledifferentiering proliferation og oncogenese 5 GATA1 er en transskriptionsfaktor der aktiveres af EPO i erytrocytternes forstadier og medforer produktion af cytoskelet haemoglobin og andre molekyler der har betydning for udviklingen og modningen af erytrocytterne og differentiering overlevelse og proliferation 6 STAT er en familie af transskriptionsfaktorer der medierer mange aspekter af cellulaer immunitet proliferation apoptose og differentiering og regulerer bl a genet for insulin like growth factor 1 7 CLK BMAL1 er transkriptionsfaktor for proteiner involveret i pattedyrenes biologiske ur Oct4 Sox2 Klf4 og c Mys er transkriptionsfaktorer for stamceller 8 Cofaktorer Rediger YAP1 yes associated protein 1 ogsa benaevnt YAP eller YAP65Se ogsa RedigerOncogen OncomiR mikroRNAReferencer og eksterne links Rediger Transcriptional Regulation by P53 Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 2010 cAMP Response Element Binding Protein CREB A Possible Signaling Molecule Link in the Pathophysiology of Schizophrenia Frontiers in Molecular Neuroscience 2018 NF kB signaling in inflammation Nature 2017 NFAT proteins key regulators of T cell development and function Nature 2005 Basic Helix Loop Helix The bHLH family of transcription factors ScienceDirect 2022 GATA1 gene GATA binding protein 1 MedlinePlus 2010 Signal Transducer and Activator of Transcription STATs Proteins in Cancer and Inflammation Functions and Therapeutic Implication Frontiers in Oncology 2019 Store opdagelser Epigenetik arvelige pavirkninger og forandringer Videenskab dk 2014 Hentet fra https da wikipedia org w index php title Transskriptionsfaktor amp oldid 11505164